یکی از چالش‌های ورزش در یزد، کمبود امکانات و فضاهای ورزشی مناسب برای تمرین و مسابقه است. به ویژه در مناطق کمتر توسعه‌یافته شهری، دسترسی به سالن‌ها و زمین‌های ورزشی با کیفیت پایین‌تر است و این امر باعث کاهش مشارکت مردم در فعالیت‌های ورزشی می‌شود. علاوه بر این، نبود حمایت‌های مالی کافی برای تیم‌ها و ورزشکاران باعث شده تا استعدادهای بالقوه کمتر شناخته شده و فرصت‌های پیشرفت برای آنها محدود باشد. رشته‌های محبوب مانند فوتبال، کشتی و والیبال طرفداران زیادی دارند اما در زمینه توسعه و حرفه‌ای شدن با مشکلاتی روبرو هستند.
از سوی دیگر، فرهنگ ورزشی در یزد به تدریج در حال تغییر است و نسل جوان بیشتر به ورزش‌های مختلف علاقه‌مند شده‌اند، اما آموزش‌های تخصصی و مربیان با تجربه در برخی رشته‌ها به اندازه کافی وجود ندارد. بهبود زیرساخت‌ها و توسعه برنامه‌های ورزشی متنوع می‌تواند باعث افزایش سلامت جسمی و روانی جامعه شود. همچنین ایجاد محیط‌های ورزشی دوستانه و تشویق به ورزش همگانی از اهمیت بالایی برخوردار است تا همه اقشار جامعه بتوانند از فواید ورزش بهره‌مند شوند و فرهنگ فعالیت بدنی در شهر بیشتر نهادینه گردد.